yes,it is的意思就是表示：“是的，它就是”，表达对某件事情的非常肯定的答复。

不过很多人在日常的用法中，经常会把Yes, it is和Yes，is it混淆在一起，认为这两种用法都差不多，其实不然，在实际英语的运用中，表达对某件事情的肯定回答的话只有Yes, it is这种用法，没有用到Yes，is it这种用法，还有就是其实在英语中有时候也会用双重否定来表示肯定，一般常用的用法就有，No, it is not。