1、培养方向不同

根据我国的有关规定，普通硕士教育以培养教学和科研人才为主，授予学位的类型主要是学术型学位,一月考试，录取后获得研究生学籍，毕业后可获硕士毕业证书和学位证书。 专业硕士是具有职业背景的硕士学位，为培养特定职业高层次专门人才而设置。

3、招生条件不同

专业硕士要求报考者有一定年限的工作经历（指在职的研究生的条件），而普通硕士则不需要。绝大多数专业硕士还要求在职人员报考需经所在单位或相应管理部门的同意，有的甚至要求所在单位推荐等。

3、招生考试不同

对普通硕士的招生考试只有年初的“统考”，而统考以外的专业考试则由各招生单位自行命题、阅卷专业硕士的招生考试有10 月份的“联考”和年初的“统考”两次机会，考生可以自行选择，而这两大国家级别的考试的专业考试，也由各招生单位自行命题、阅卷（这里偏向于说在职）。

4、学习方式不同

普通硕士： 全日制学习。一般为3 年。

专业硕士：半脱产，学制2－3 年（这里偏向指在职的）。

5、学习费用不同

普通硕士录取为国家计划内（非定向、定向）的硕士生按国家规定享受免学费待遇。录取为国家计划外（委托培养、自筹经费）的硕士生须缴纳学费，一般为8000 元/年，不同专业有所不同。

专业硕士学费按照不同专业类别差别较大。例如，MBA 的学费要十几甚至几十万元，而工程硕士的学费一般为3到4 万元。专业硕士学位一般不能申请国家助学贷款（偏向于说在职研究生）。

6、文凭颁发不同

与普通硕士不同，大多数专业硕士（在职）只授予学位证书，没有学历证书。但也有例外，例如工商管理硕士、法律硕士、临床医学硕士、建筑学硕士等，就同时颁发学位和学历证书。大体来看，“统考”生拿“双证”，“联考”生拿“单证”。