途经连云港市、灌云县、灌南县、涟水县、淮安市(清河区、淮安区)、宝应县、高邮市、扬州市(江都区、广陵区)、镇江市(镇江新区)等县市(区)。

灌云共有站台2座,到发线4条,途经线路为连镇铁路。连镇铁路地处我国东部沿海地带,位于江苏省南北纵向中轴线上。线路北起连云港市,沿宁连高速公路引入淮安市,与京杭运河、京沪高速公路并行,向南经苏中扬州市,跨长江后止于苏南镇江市,正线全长304.537公里,总投资464亿元。全线共设车站(线路所)16座。

灌云站还包含汽车客运站、交通指挥中心和公交首末站、出租车蓄发区、社会停车场、站前广场和地下停车场等场站设施,各交通服务功能区通过地下通道或地面风雨连廊等设施相互联系,实现多种交通运输方式的“无缝”对接和出行旅客的零距离换乘。